Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG9BQ674R7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms