Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYT6Q5T7P8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms