Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCTE1Q5JU00 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms