Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms