Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms