Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms