Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPAT3Q53EU6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms