Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms