Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms