Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms