Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HFEQ30201 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HFEQ30201 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HFEQ30201 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HFEQ30201 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HFEQ30201 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HFEQ30201 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms