Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms