Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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