Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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GEN1Q17RS7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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