Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms