Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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