Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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