Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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FXNQ16595 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXNQ16595 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXNQ16595 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXNQ16595 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXNQ16595 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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FXNQ16595 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXNQ16595 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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FXNQ16595 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXNQ16595 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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FXNQ16595 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXNQ16595 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXNQ16595 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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FXNQ16595 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FXNQ16595 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXNQ16595 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXNQ16595 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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FXNQ16595 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXNQ16595 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXNQ16595 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXNQ16595 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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