Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms