Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP7Q16576 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms