Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms