Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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VPS72Q15906 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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