Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms