Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA1Q15788 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms