Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SS18Q15532 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms