Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms