Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms