Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PUM3Q15397 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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