Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
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EEA1Q15075 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
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