Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms