Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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