Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLCA4Q14CN2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLCA4Q14CN2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCA4Q14CN2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCA4Q14CN2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCA4Q14CN2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCA4Q14CN2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCA4Q14CN2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCA4Q14CN2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCA4Q14CN2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCA4Q14CN2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCA4Q14CN2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCA4Q14CN2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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