Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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