Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT33BQ14525 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms