Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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