Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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