Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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TUBA3CQ13748 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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TUBA3CQ13748 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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TUBA3CQ13748 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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TUBA3CQ13748 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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TUBA3CQ13748 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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TUBA3CQ13748 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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TUBA3CQ13748 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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TUBA3CQ13748 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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