Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAMK2DQ13557 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAMK2DQ13557 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAMK2DQ13557 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAMK2DQ13557 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAMK2DQ13557 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAMK2DQ13557 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAMK2DQ13557 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAMK2DQ13557 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CAMK2DQ13557 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAMK2DQ13557 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAMK2DQ13557 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAMK2DQ13557 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAMK2DQ13557 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms