Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATRQ13535 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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