Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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PTPRSQ13332 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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PTPRSQ13332 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PTPRSQ13332 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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PTPRSQ13332 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PTPRSQ13332 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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