Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms