Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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