Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ANK3Q12955 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ANK3Q12955 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms