Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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