Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms