Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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