Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms