Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms