Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms