Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms